Totuus ei ole tullut julki. Virallinen onnettomuustutkintahan oli erittäin puutteellinen ja täynnä valheita. Todisteita hävitettiin, asioista valehdeltiin, silminnäkijöiden havainnot sivuutettiin jos ne eivät sopineet ennalta sovittuun uppoamissyyhyn ja aikatauluun. Tutkintakomission puheenjohtaja Andi Meister erosi koska ei halunnut enää valehdella.
Asiantuntijat ympäri maailmaa ovat täysin yksimielisiä siitä että Estonia ei ole voinut upota kuten virallinen onnettomuustutkinta väittää.
Vielä 18 vuotta uppoamisen jälkeenkin on vastaamatta mm. seuraaviin kysymyksiin:
Mitä Estonialla kuljetettiin uppoamisyönä? Miksi Johan Hirschfeldt määrättiin hävittämään todistusaineistoa Estonian asekuljetuksista?
Miksi Estline sai ennen uppoamista pommiuhkauksia?
Miksi asekuljetukset kiellettiin 10 vuoden ajan?
Miksi Naton sotilaat olivat Tallinnan satamassa valvomassa Estonian lastausta? Miksi kaikkia rekkoja ei merkitty rahtikirjaan?
Miksi todistajien lausuntoja siitä, että keulaportti oli aivan viime hetkiin asti kiinni laivassa, ei huomioitu?
Miksi vettä tuli autokannen alapuoliselle 0-kannelle alhaalta päin?
Miksi Estonian oikeassa kyljessä on reikä? Miksi virallinen onnettomuustutkinta kiistää tämän?
Miksi Itämeren alueen radioliikennettä häiriköitiin onnettomuusyönä?
Miksi Kari Lehtola valehteli aluksi hylyn sijainnista? Tämän takia mm. uhrien muistotilaisuus järjestettiin väärällä paikalla.
Miksi Balanga Queen määrättiin Estonian upottua Tallinnan satamaan eikä Estoniaa auttamaan?
Miksi osa pelastuneista (kaikki Estonian miehistöä) katosi mystisesti? Omaisille ilmoitettiin usealta eri taholta että henkilö on elossa ja ilmoitettiin jopa lennon numeroita millä tulevat Tallinnaan.
Mihin Avo Piht katosi? Hänen vahvistettiin pelastuneen ja häntä oli jopa ehditty jo kuulustella. Esimerkiksi Viron sisäministeriö tiedotti illalla 28.9.1994 että Piht on pelastettu, myös myöhemmissä tiedotteissa mainittiin Pihtin nimi.
Miten Kalev Vahtras kuoli? Selvisi elossa ja oli Turun sairaalassa hyvässä kunnossa. Myöhemmin tuli ilmoitus omaisille että Kalev on kuollut. Ruumis vietiin Tallinnaan, jossa Kalevin vaimo huomasi että kyseessä on väärän miehen ruumis. Myöhemmin omaiset saivat sentään oikean ruumiin mutta se oli täynnä pahoinpitelyvammoja. Mitä Kaleville tapahtui Suomessa?
Kalevin huonetoveri Turussa, Silver Linde, tuomittiin myöhemmin Suomessa huumausaineiden salakuljetuksesta vankeuteen. Ei saanut oikeudenkäyntiinsä edes tulkkia. Näinkö raivataan todistajat tieltä pois?
Miksi laiva haluttiin peittää betonilla? Miksi valehdeltiin että betonilla peittäminen tulee halvemmaksi kuin ruumiiden nostaminen? Miksi omaisten mielipiteitä ei kuunneltu? Miksi Carl Bildt lupasi ensin nostaa laivan, mutta perui myöhemmin puheensa? Tämän jälkeenhän Ruotsissa perustettiin Eettinen neuvosto, joka päätyi siihen tulokseen että ruumiita ja/tai hylkyä ei voi nostaa koska A) sukeltajat järkyttyvät jos joutuvat nostamaan ruumiita ja B) osalle omaisista tulee paha mieli jos kaikkia ruumiita ei löydetä. Kuitenkin nämä sukeltajat kykenivät merenpohjassa liikuttelemaan ruumiita...
Miksi valehdeltiin että laivan edustalla ei ole kuin muutama ruumis vaikka todellisuudessa pelkästään laivan läheisyydessä oli satakunta ruumista?
Miksi tutkintakomissio valehteli että autokannelle ei sukellettu koska se olisi ollut liian vaarallista?
Miksi sukeltajilla (virallisen onnettomuuslautakunnan eli Rockwaterin sukeltajia) on elinikäinen kielto puhua mistään Estoniaan liittyvästä?
Rockwaterin sukeltajien lisäksi Estonialle sukelsi muitakin, joista Ruotsin viranomaiset olivat tietoisia. Näitä sukeltajia näkyy Rockwaterin sukeltajien videoilla. Keitä he olivat? Mitä etsivät?
Miksi pelastaja Kenneth Svensson väitti pelastaneensa 8 ihmistä mutta myöhemmin muutti luvun kuuteen?
Miksi Mariellalle pelastettujen määrä on valehdeltu virallisessa tutkintaraportissa?